問答題在修建商業(yè)中心的東方商場(chǎng)和商業(yè)大廈工程中，開挖基礎(chǔ)坑時(shí)，發(fā)現(xiàn)大量化石和古人類文明遺址，經(jīng)有關(guān)部門及專家鑒定為遠(yuǎn)古類人猿活動(dòng)遺址，有重大考古價(jià)值，經(jīng)國家有關(guān)部門和業(yè)主協(xié)商決定在該處進(jìn)行發(fā)掘工作，并與承包方協(xié)商后決定由承包方抽調(diào)部分力量參與與文物發(fā)掘工作。經(jīng)過40天發(fā)掘工作基本結(jié)束。為此，承包方向發(fā)包方提出要求補(bǔ)償參與考古發(fā)掘工作的直接費(fèi)用48萬元，由于工程暫停和延期造成的勞動(dòng)力和機(jī)械設(shè)備閑置等損失32萬元、20％管理費(fèi)和10％利潤(rùn)，以及延長(zhǎng)工期40天。當(dāng)在施工中發(fā)現(xiàn)地下化石及文物后，工程師應(yīng)該按照什么程序處理？