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PSI-BLAST
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位點特異性迭代比對。是一種專門化的的比對,通過調(diào)節(jié)序列打分矩陣(scoringmatrix)探測遠緣相關(guān)的蛋白。
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模塊替代矩陣。矩陣中的每個位點的分值來自蛋白比對的局部塊中的替代頻率的觀察。每個矩陣適合特定的進化距離。例如,在BLOS...
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PAM矩陣
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