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問答題
【簡答題】什么是序列比對中使用的PAM矩陣和BLOSUM矩陣,它們的作用是什么,一般BLAST選擇使用的矩陣是什么
答案:
PAM矩陣和BLOSUM矩陣都是用于序列相似性的記分矩陣(scoring matrix)。記分矩陣中含有對齊時具體使用的...
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問答題
【簡答題】BLAST中,E值和P值分別是什么,它們有什么意義?
答案:
BLAST中使用的統(tǒng)計值有概率p值和期望e值。
E期望值(E-value)這個數值表示你僅僅因為隨機性造成獲得...
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問答題
【簡答題】假設你得到一段未知蛋白的氨基酸序列,從你學習到的生物信息學分析方法和軟件,設計一個分析流程來分析該未知蛋白的功能和家族類別以及其結構預測。
答案:
1、用該序列進行BLASTP搜索。
2、再對其進行蛋白質結構域、功能域的搜索,可以用Znterproscan、...
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