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SRS(sequence retrieval system)
答案:
序列查詢系統(tǒng),是EBI提供的多數(shù)據(jù)庫查詢工具之一。有與Entrez類似的功能外,還提供了一系列的序列分析工具,可以直接進...
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名詞解釋
SWLSS—MODE
答案:
是目前最著名的蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)預(yù)測服務(wù)器,建立在已知生物大分子結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)上,利用同源建模的方法對未知序列的蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)進行...
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名詞解釋
homology modeling
答案:
是目前最為成功且實用的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測方法,它的前提是已知一個或多個同源蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)。當(dāng)兩個蛋白質(zhì)的序列同源性高于35%,...
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名詞解釋
Ab initio prediction
答案:
蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)預(yù)測方法—從頭預(yù)測法,在既沒有已知結(jié)構(gòu)的同源蛋白質(zhì)、也沒有已知結(jié)構(gòu)的遠程同源蛋白質(zhì)的情況下,只能采用從頭預(yù)...
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名詞解釋
molecular phylogenetic tree
答案:
分子進化樹,精確地反映物種間或群體間在進化過程中發(fā)生的極微細的遺傳變異,而且借助化石提供的大分子類群的分化年代能定量地估...
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名詞解釋
gene tree
答案:
基因樹,表示一組基因或一組DNA順序進化關(guān)系的系統(tǒng)發(fā)生樹。
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名詞解釋
neighbor—joining method
答案:
鄰接法,基于最小進化原理經(jīng)常被使用的一種算法,它不檢驗所有可能的拓撲結(jié)構(gòu),能同時給出拓撲結(jié)構(gòu)和分支長度。在重建系統(tǒng)發(fā)生樹...
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名詞解釋
maximum parsimony method
答案:
最大簡約法基于進化過程中所需核苷酸(或氨基酸)替代數(shù)目最少的假說,對所有可能正確的拓撲結(jié)構(gòu)進行計算并挑選出所需替代數(shù)最小...
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名詞解釋
MEGA(Molecular Evolutionary Genetics Analysis)
答案:
是一款免費的構(gòu)樹軟件,它提供了序列比對、格式轉(zhuǎn)換、數(shù)據(jù)修訂、距離計算、系統(tǒng)樹重建和可信度評估等全套功能,能對DNA、mR...
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BioEdit
答案:
BioEdit是一個序列編輯器與分析工具軟件。功能包括:序列編輯、外掛分析程序、RNA分析、尋找特征序列、支持超過200...
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名詞解釋
EST
答案:
表達序列標(biāo)簽—是從一個隨機選擇的cDNA克隆,進行5’端和3’端單一次測序挑選出來獲...
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