轉座酶一旦合成就立即與DNA結合,以免擴散到基因組的其它組件中。有假說認為轉座的半衰期很短,若與DNA結合則較為穩(wěn)定。
在復制轉座中會形成一個共整合中間體,其中含有兩個方向相同的轉座子拷貝,并由原復制子隔開。