生物信息學章節(jié)練習(2020.05.17)

來源:考試資料網(wǎng)
1.名詞解釋空位罰分
參考答案:空位罰分是為了補償插入和缺失對序列相似性的影響,序列中的空位的引入不代表真正的進化事件,所以要對其進行罰分,空位罰分的多...
參考答案:它對每個可能的進化位點分配一個概率,然后綜合所有位點,找到概率最大的進化樹。最大似然法允許采用不同的進化模型對變異進行分...
參考答案:(1)選擇菜單file,
(2)選擇Text File Editor and Format Coverter工...
參考答案:核酸序列得分系統(tǒng)比較簡單,只需要考慮匹配、不匹配及空位罰分這三種情況;而蛋白序列比對就要復雜得多,除了考慮匹配和空位罰分...
6.名詞解釋標度樹
參考答案:

指分支長度和相鄰節(jié)點對之間的差異成比例的系統(tǒng)發(fā)生樹。

7.名詞解釋極性鍵
參考答案:

在一個帶全正電的分子和另一個帶全負電的分子之間發(fā)生的相互作用。

參考答案:(1)多序列比對:ClustalW
(2)校對比對結果:BIOEDIT
(3)建樹:MEGA ...
參考答案:

在替換矩陣中,每個位置的打分是在相關蛋白局部比對模塊中觀察到的替換的頻率而獲得的,每個矩陣被修改成一個特殊的進化距離。

10.名詞解釋二級結構
參考答案:

指源自蛋白質(zhì)一級結構的α螺旋、β折疊等局部結構特征。